Тайна морского котика

Сюжет анимационного сериала «Мария † Холик» строится вокруг взаимодействия двух студентов. Канако Миямаэ, студентка, испытывающая неприязнь к мужчинам, поступает в Академию Небесных Королев. Вскоре после прибытия она знакомится с Марией Шидо, популярной и привлекательной ученицей, которая производит на неё сильное впечатление. После короткой беседы Мария проявляет к Канако неожиданную нежность.

Их общение продолжается, и Канако узнаёт, что Мария живёт не в общежитии, а в отдельной квартире. Заинтригованная, Канако решает навестить её. Во время этого визита она становится свидетельницей неожиданного открытия: Мария Шидо, считающаяся одной из красивейших девушек академии, на самом деле является юношей, скрывающим свой настоящий пол.

Это открытие становится отправной точкой для развития их дальнейших отношений. Сюжет исследует, как Канако справляется с этим знанием, учитывая её неприятие мужчин, и как складывается её общение с Марией, который продолжает вести двойную жизнь. Их взаимодействие задаёт основную динамику повествования.