Детектив Конан: Алое алиби

События сериала сосредоточены на девушке по кодовому имени Ноль Два. Она, как и другие персонажи в её окружении, идентифицируется подобным номером. В начале повествования у героини наблюдаются провалы в памяти неизвестного происхождения. Единственное, что она может чётко вспомнить — это факт своего заключения. Предшествующие этому события полностью стёрты из её памяти. Периодически Ноль Два видит фрагментарные воспоминания о женщине, исполнявшей роль её матери. Эта женщина сыграла значительную роль в её воспитании. Позже в памяти героини возникает эпизод, где та же женщина приносит ей книгу с иллюстрациями.

Содержание книги не привлекло внимания Ноль Два, в отличие от изображений внутри неё. Как выясняется, несколько лет назад над главной героиней проводились нестандартные эксперименты в учреждении под названием «Сад». Это была лаборатория, специализировавшаяся на подобных исследованиях. Находясь в «Саду», Ноль Два знакомится с мальчиком по имени Хиро, имеющим кодовое имя Ноль Шестнадцать. Они совместно предпринимают попытку побега из лаборатории, но их задерживают практически сразу. В этот момент Хиро даёт обещание когда-нибудь жениться на Ноль Два.

После поимки беглецам полностью стирают память, в результате чего они забывают друг о друге. Однако позже у Ноль Два начинают возвращаться воспоминания о человеке, к которому она испытывала симпатию. Это побуждает её начать поиски, чтобы вновь его найти.